“政府采購代理機構(gòu)資格認定”是按照政府采購法有關(guān)規(guī)定開展的一項行政許可事項。為此，2005年12月28日，財政部頒布了《政府采購代理機構(gòu)資格認定辦法》（財政部令第31號，以下簡稱“31號令”），對政府采購代理機構(gòu)資格認定的一般程序、審批和確認的資格條件、資格延續(xù)與變更、代理機構(gòu)資格監(jiān)督管理等作出規(guī)定。自2006年3月1日該辦法施行起，從事政府采購代理業(yè)務(wù)的機構(gòu)必須按照規(guī)定取得政府采購代理機構(gòu)資格。根據(jù)該《辦法》規(guī)定，省級以上人民政府財政部門應(yīng)當向認定資格的政府采購代理機構(gòu)頒發(fā)《政府采購代理機構(gòu)資格證書》，有效期為三年惱府采購代理機構(gòu)需要延續(xù)依法取得的政府采購代理機構(gòu)資格有效期的，應(yīng)當在《政府采購代理機構(gòu)資格證書》載明的有效期屆滿60日前，向作出資格認定決定的財政部門提出申請。 

摹∷孀耪府采購制度改革的深化，31號令逐漸難以適應(yīng)政府采購代理市場發(fā)展和進一步規(guī)范、加強對政府采購代理機構(gòu)監(jiān)督管理的需要。為此，2010年，財政部對31號令進行了修訂，并以財政部第61號部長令的形式公布，于2010年12月1日起施行。其中修訂的內(nèi)容主要包括取消了政府采購代理機構(gòu)資格認定中的確認資格方式，補充了政府采購代理機構(gòu)代理業(yè)務(wù)的限制性條款，規(guī)范和完善了申請政府采購代理機構(gòu)資格的條件，明確了政府采購代理機構(gòu)資格延續(xù)的條件，完善了對政府采購代理機構(gòu)的監(jiān)督檢查以及補充了法律責任等6個方面。同時，財政部還發(fā)文明確，將定期集中對甲級代理機構(gòu)進行資格審查認定，代理機構(gòu)申報材料的遞交時間為每年6月1日、11月1日開始的5個工作日內(nèi)。2013年，為進一步簡化行政審批程序，創(chuàng)建服務(wù)型政府，方便代理機構(gòu)申報政府采購甲級代理資格，財政部對政府采購代理機構(gòu)資格集中審查認定的時間進行調(diào)整，即由一年兩次形每月一次。

　　政府采購代理機構(gòu)資格審批制的實行，雖然對規(guī)范代理機構(gòu)市場頗有成效，但也在一定程度上限制了這一市場的發(fā)展。因此，為了進一步落實簡政放權(quán)要求，激發(fā)市場活力，這一制度也走向了終結(jié)。2014年7月9日召開的國務(wù)院常務(wù)會議通過政府采購法等法行拚案草案和行政法規(guī)修改決定。8月31日，第十二屆全國人民代表大會常務(wù)委員會第十次會議通過修改政府采購法等五部法律的決定。其中明確，自2014年8月31日起，取消財政部及省級人民政府財政部門負責實施的政府采購代理機構(gòu)資格認定行政許可事項。此后，財政部立即印發(fā)通知停姓府采購代理機構(gòu)資格認定工作，并明確了具體工作措施。一是對政府采購代理機構(gòu)不再發(fā)放資格證書、不再設(shè)定資格條件、不再進行事前審核。二是建立登記制度，按照“自愿、免費、一地登記、全國通用”的原則，對代理機構(gòu)進行網(wǎng)上登記。三是將完成登記的代理機構(gòu)自動納入中國政脅曬和“政府采購代理機構(gòu)名單”，并向社會公開代理機構(gòu)相關(guān)信息。

　　自此，實行了8年多的政府采購代理機構(gòu)資格認定制度正式取消，政府采購代理機構(gòu)管理進入“登記制時代”。

　　2015年2月，時任財政部部長樓繼偉簽署中華人民共和國財政部令第77號《財政部關(guān)于廢止部分規(guī)章和規(guī)范性文件的決定》，正式廢止《政府采購代理機構(gòu)資格認定辦法》（財政部令第61號）等七件涉及審批事項的規(guī)章和規(guī)范性文件，自2015年2月11日起實施。61號令自此正式退出“歷史舞臺”。

　　實行登記制后，財政部按照“寬進嚴管”7思路，加強對社會代理機構(gòu)執(zhí)業(yè)情況的監(jiān)督檢查，每年都組織全國省市縣三級財政部門開展全國聯(lián)動的代理機構(gòu)監(jiān)督檢查，并對違法線索進行延伸檢查。2015至2016年，全國共檢查2875家社會代理機構(gòu)，對其中2578家作出行政處理處罰。

　　2018年1月，財政部出臺《政府采購代理機構(gòu)管理暫行辦法》，從名錄登記、從業(yè)管理、信用評價及監(jiān)督檢查等方面對政府采購代理機構(gòu)監(jiān)督管理做了全面規(guī)定，以此加強監(jiān)督管理，促進政府采購代理機構(gòu)規(guī)范發(fā)展。該辦法自2018年3月1日施行。